Le Machu Picchu (signifiant en Quechua vieille montagne) est une ancienne citée inca du 15 ème siècle. Sa fonction aujourd'hui reste toujours un mystère, serait- il un lieu de résidence d'empreurs Incas (de Pachacutec ou Inca Yupanqui), mais son caractère religieux n'est pas non plus à exclure. De même, ma date de sa réelle reste indéfinie. En effet, officiellement ce serait l'Américain Hiram Bingham, un historien américain de Yale qui effectuait des recherches sur la ville perdue de Vilcabamba, le dernier refuge de l'Inca, entend parler de Lizagarra. Accompagné par ses guides, le sergent de la garde civile Carrasco et le paysan Melchor Arteaga, il se rend à Machu Picchu le 24 juin 1911.Ils rencontrèrent deux familles de paysans vivant là : les Recharte et les Alvarez qui utilisaient encore les constructions pour se ravitailler en eau. C'est un des fils Recharte qui conduisit Bingham jusqu'à la zone urbaine en friche.
Les premières références directes, actuellement connues sur le site, indiquent que Augustin Lizarraga, originaire de Cusco, arriva dans la ville le 14 juillet 1902 guidant Gabino Sanchez, Enrique Palma et Justo Ochoa. Les visiteurs laissèrent un graffiti avec leurs noms sur les murs du Templo de las Tres Ventanas ; Hiram Bingham trouva le graffiti en 1911 comme il l'affirme dans son livre de 1922. Certains affirment que Lizarraga aurait déjà visité Machu Picchu en 1894.
Cependant depuis début juin 2008, de nouvelles sources sont apparues. De nouvelles recherches publiés en 2008 par l'historien Paolo Greer, suggèrent que c'est le prospecteur de mines allemand Augusto R. Berns qui aurait redécouvert le site vers 1860. Il aurait même commencé le pillage des artéfacts avec l'aval des autorités péruviennes de l'époque. Mais rien n'est reéllement officiel.